Seit 2013 leitet Gernot Sieg den Lehrstuhl für Industrieökonomik, insbesondere Infrastruktur- und Verkehrsökonomik an der Universität Münster und ist Direktor des Instituts für Verkehrswissenschaft Münster. Zuvor war er Direktor des Instituts für Volkswirtschaftslehre der TU Braunschweig. Längere Lehr- und Forschungsaufenthalte verbrachte er an der University of Southern California und der Free University of Bozen. Gernot Sieg befasst sich mit der Industrieökonomik von Verkehrsmärkten und ist Experte für Verkehrspolitik. Er veröffentlichte seine Forschungsergebnisse in Fachjournalen wie Transportation, Transportation Research Part B, D and E, Journal of Economic Dynamics and Control, Economics Letters,Transportation Letters,  Public Choice, Journal of Transport Economics and Policy, Economics of Transportation u.a. Seine Arbeiten fanden Widerhall in Medien wie Welt am Sonntag, spiegel online, FAZ, brand eins, New York Times, Süddeutsche, dpa, Wall Street Journal. Gernot Sieg ist Mitglied des Wissenschaftlichen Beirats beim Bundesminister für Verkehr, dessen Vorsitzender er 2024 und 2025 war.